《X档案 第十季》带着七十年前的罗斯威尔事件的谜团再次回归，令人震撼不已。这一事件至今仍然在全球范围内产生巨大的影响，然而真相的面纱依然未被揭开。很少有人知晓完整的真相，即便它就在我们身边。在这个充满神秘色彩的背景下，前联邦调查员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）与他的亲密合作伙伴丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）再度携手出击，重新踏上了解开种种谜团的征程。

曾经生活颓废的穆德和现在在教会医院担任医师的斯科莉，受到一档揭露政治黑幕的节目主持人的启发。这位主持人希望他们揭示政客如何利用外星人来操控人类，从而揭示隐藏在背后的真相。在这个关键时刻，长期被封闭的X档案再次被打开，揭示出一个新的世界。穆德曾一度对各种匪夷所思的事件失去信心，但在斯科莉的陪伴下，他决定再次投身于这个神秘的领域。